Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PUM3Q15397 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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