Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3GAP1Q15042 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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