Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHPRHQ149N8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHPRHQ149N8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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