Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP1A4Q13733 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms