Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA7Q13683 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms