Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4AQ13619 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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