Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX6Q13608 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PEX6Q13608 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms