Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BFSP2Q13515 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms