Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TOP3AQ13472 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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