Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SCGB2A2Q13296 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SCGB2A2Q13296 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCGB2A2Q13296 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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