Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NME3Q13232 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NME3Q13232 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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