Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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SEMA3BQ13214 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SEMA3BQ13214 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3BQ13214 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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