Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHAF1BQ13112 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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