Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXF2Q12947 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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