Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-212ENST00000477534 930 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-208ENST00000449627 909 ntTSL 44.75□□□□□ -1.651e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 54.27□□□□□ -1.731e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-217ENST00000544309 581 ntTSL 318.28■□□□□ 0.521e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-202ENST00000421879 583 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-209ENST00000491310 525 ntTSL 513.74□□□□□ -0.211e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 313.24□□□□□ -0.291e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-205ENST00000448607 559 ntTSL 411.93□□□□□ -0.51e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.118e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 211.32□□□□□ -0.64e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.524e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 WDTC1-205ENST00000491239 5149 ntTSL 213.2□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 211.6□□□□□ -0.553e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 EIF3L-204ENST00000414316 581 ntTSL 56.27□□□□□ -1.414e-9■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 EIF3L-208ENST00000451427 583 ntTSL 44.8□□□□□ -1.644e-9■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 CADM1-205ENST00000536781 575 ntTSL 418.97■□□□□ 0.632e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 CTCF-203ENST00000566078 1627 ntTSL 229.75■■■□□ 2.351e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.992e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-207ENST00000509462 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.81■■□□□ 1.41e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-206ENST00000508954 1057 ntTSL 223.67■■□□□ 1.381e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-206ENST00000511552 1036 ntTSL 322.37■■□□□ 1.172e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-210ENST00000475757 1073 ntTSL 220.92■□□□□ 0.942e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-208ENST00000512152 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.74■□□□□ 0.911e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-203ENST00000503245 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.71■□□□□ 0.911e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NFS1-212ENST00000489163 602 ntTSL 320.05■□□□□ 0.82e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.72e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.71e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 CABIN1-208ENST00000467937 593 ntTSL 318.43■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 417.21■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 216.77■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 516.64■□□□□ 0.258e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 316.08■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 415.88■□□□□ 0.138e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-213ENST00000531240 559 ntTSL 415.52■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-208ENST00000440228 620 ntTSL 415.45■□□□□ 0.062e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.068e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 08e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-216ENST00000486421 505 ntTSL 514.87□□□□□ -0.038e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.038e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.048e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.048e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 314.64□□□□□ -0.078e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.138e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.181e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-218ENST00000491103 871 ntTSL 513.76□□□□□ -0.218e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.268e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.38e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.38e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 313.12□□□□□ -0.311e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TNRC6A-211ENST00000566108 454 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 412.29□□□□□ -0.448e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 512.26□□□□□ -0.458e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-203ENST00000506395 1606 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 311.45□□□□□ -0.581e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-9■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 410.69□□□□□ -0.78e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 48.44□□□□□ -1.061e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.182e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TAF9-204ENST00000504109 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.49□□□□□ -1.371e-10■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 36.4□□□□□ -1.388e-14■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.472e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 25.56□□□□□ -1.522e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 PRRC2C-211ENST00000495585 5566 ntTSL 1 (best)4.87□□□□□ -1.635e-9■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-7■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 216.4■□□□□ 0.222e-8■■□□□ 14.1
ILF3Q12906 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.092e-31■■□□□ 14
ILF3Q12906 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC8.62□□□□□ -1.032e-31■■□□□ 14
ILF3Q12906 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.037e-9■■□□□ 14
ILF3Q12906 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 214.87□□□□□ -0.037e-9■■□□□ 14
ILF3Q12906 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.867e-9■■□□□ 14
ILF3Q12906 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.977e-9■■□□□ 14
ILF3Q12906 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 14
ILF3Q12906 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-7■■□□□ 14
ILF3Q12906 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 14
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 126.3 ms