Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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