Protein–RNA interactions for Protein: Q12798

CETN1, Centrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN1Q12798 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CETN1Q12798 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CETN1Q12798 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms