Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RBBP4Q09028 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms