Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP3CAQ08209 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPP3CAQ08209 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms