Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LRP1Q07954 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms