Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms