Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TNP2Q05952 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms