Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPCQ03188 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPCQ03188 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms