Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCCQ00597 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms