Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD1P98174 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD1P98174 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms