Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX1P78337 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX1P78337 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX1P78337 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX1P78337 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX1P78337 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX1P78337 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX1P78337 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms