Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERVK_113P62684 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms