Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UFM1P61960 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UFM1P61960 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UFM1P61960 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UFM1P61960 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms