Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CABP4P57796 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms