Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GJA9P57773 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms