Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME5P56597 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME5P56597 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NME5P56597 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NME5P56597 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms