Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH15P55291 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDH15P55291 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms