Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GDF10P55107 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GDF10P55107 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GDF10P55107 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms