Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms