Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A2P52657 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms