Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E1P51965 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E1P51965 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E1P51965 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E1P51965 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms