Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA2P51531 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA2P51531 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms