Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms