Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNI2P48788 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms