Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A3P48751 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A3P48751 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms