Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PITPNBP48739 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms