Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAPZBP47756 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms