Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTRNP46939 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UTRNP46939 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UTRNP46939 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms