Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms