Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC19A1P41440 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC19A1P41440 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms