Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms