Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBRP36941 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBRP36941 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBRP36941 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LTBRP36941 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms