Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD13P35453 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms