Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP6P35125 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP6P35125 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP6P35125 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP6P35125 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP6P35125 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP6P35125 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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