Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLIP1P30622 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLIP1P30622 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms